No Grupo 1, o destaque ficou para o Marília, que venceu o Mirassol por 3 a 2 em um jogo emocionante, com duas viradas e um gol olímpico de Camilo, do Mirassol. Com essa vitória, o Marília terminou em segundo lugar da chave, com 16 pontos, e avançou para as quartas de final com a sétima melhor campanha geral.
O Grêmio Prudente também se classificou, mesmo empatando por 2 a 2 com o São Bento. A equipe ficou em terceiro lugar no grupo, com 15 pontos, e avançou como segundo melhor terceiro colocado e oitavo colocado na classificação geral. O Mirassol, que também tinha o mesmo número de pontos, vitórias, saldo de gols e gols pró, acabou sendo eliminado por ter mais cartões vermelhos.
No Grupo 2, o Juventus garantiu sua vaga ao vencer a Ponte Preta por 3 a 1. O time terminou em segundo lugar, com 19 pontos, e na sexta posição geral. Já o XV de Piracicaba, que já estava classificado, empatou por 1 a 1 com o Primavera e terminou em primeiro lugar no grupo, com 22 pontos.
No Grupo 3, a Portuguesa ficou na primeira posição, tanto do grupo quanto na classificação geral, ao vencer o São Caetano por 2 a 0. O São José também se classificou, após vencer o Santo André por 2 a 0. Ambos os times somaram 23 pontos, mas o saldo de gols do São José foi menor, fazendo com que a Portuguesa ficasse na liderança. A Portuguesa Santista também avançou como melhor terceiro colocado, após vencer o EC São Bernardo por 1 a 0.
Nas quartas de final, as equipes serão divididas de acordo com as melhores campanhas, enfrentando os times de colocação inferior. O critério de desempate será pelo placar agregado, com a decisão indo para os pênaltis em caso de empate.
Além da classificação para as quartas de final, o campeão da Copa Paulista terá o direito de escolher uma vaga na Série D do Campeonato Brasileiro ou na Copa do Brasil da próxima temporada. O vice-campeão ficará com a vaga restante.
